内分泌学的发展，使一些气功现象得到解释，表明气功效应与人体内激素有密切关系，现就此略抒己见。
　　一、丹田与内分泌腺体
　　道家内丹术认为，人体有四大关窍——丹田、气海、神宝和泥丸宫，一般称为上、中、下三个丹田，分阶段意守这些部位，不仅可以祛病强身，延年益寿，有的人还可以练出特异功能。这三个部位分别与经络穴位印堂、膻中、神阙相对，和百会、会阴连成一条直线，而这几个部位及其连线上下正是人体内分泌系统的关键腺体所在。(见附图)
　　上丹田又称泥丸宫，在两眉之间印堂穴入内三寸，脑垂体正位于此。垂体产生促肾上腺皮质等多种促激素，控制全身各内分泌腺的功能，并管理人体的生长发育，是内分泌系统的“统辖部”。上丹田以垂体为中心点向上与下丘脑相连，下丘脑分泌促释放或抑制激素，调节垂体激素的分泌。脑垂体，下丘脑在间脑底部，与人体特异功能有密切关系的松果体在间脑顶端。间脑是脑的中心部位。在松果体与脑垂体前方是大脑额叶(在前额内)，大脑显像反应在这个部位。
　　中丹田在两乳之间的膻中穴以内，膈肌之上，上与胸腺相连。胸腺分泌胸腺素，与免疫机制关系密切，它的四周是心、肺、肝、脾、胃等重要器官。巳发现肝、胆、肺、胃等均有内分泌功能，如新近发现的心脏激素，定名为“人脑性纳利尿缩氨酸”，具有调节血压和利尿的功能。
　　下丹田在脐下。一种解释“脐下”是站立时的脐下，另一种是仰卧时的脐下，我同意后一种解释。即在脐(神阙穴)内。实验证明，神阙穴在人体生理上比其下诸穴更为重要，是人体科学中的一个奥秘所在。明代邱长春在《大丹直指》中谈到“性功”与“命功”时说：“性者天也，常潜于顶，命者地也，常潜于脐，顶者性根也，脐者命蒂也。”巳说明脐部为下丹田。
　　下丹田乃藏精纳气之所，其后两侧是肾、肾上腺，其上为胰岛，其下有分泌生殖激素的重要腺体，各派气功一般都把下丹田作为意守的首选部位，因此有人称之为“正丹田”。肾上腺皮质产生类固醇化合物，调节水与电解质的平衡，对糖、脂肪和蛋白质的代谢起着重要作用，同时可使机体应付紧急情况，使人产生很强的爆发力。肾脏也具有重要的内分泌功能，主要产生肾素、促红细胞生成素，前列腺素等激素，对人体血管舒缩、醛固酮分泌，骨髓造血、钙代谢等生理活动起调节作用。
　　二、从“应激反应”看气功与内分泌系统的关系
　　人体有很大的潜力，在紧急情况下，交感神经兴奋，肾上腺分泌迅速增加，使心跳、呼吸加快，血糖含量增加，皮肤和腹腔血管收缩，而对大脑、心脏和骨骼肌的供血量增加，人体反应速度加快，思维活跃，从而调动人体的潜在能力。有报道说，一个妇女抱着小孩儿行走，一辆卡车冲来，她居然跳过了路边的围墙，这在平时是绝对办不到的。这种潜力，常人在受到严重威胁时才能激发出来，所以叫做“应激反应”。危重病人在临死前出现的“回光反照”，也属这个范畴，一但各种激素和能量消耗殆尽，便衰竭而死。
　　气功锻炼，能够调节内分泌，掌握这种潜力，并运用自如。气功师以手劈砖、碎石，就是激发潜在能力的结果。大家知道，气功师发功都有一个“动员”阶段，以便在意念引导下，激发潜在的能力。功底深厚的人，这个过程短一些；功底不深，或者难度较大的功夫，必须全身总动员才能奏效，所以任何气功师都不能随心所欲，连续不断地发功，整天将手当作铁榔头使用。这是因为人体的激素分泌和能量储备都是有限的，必须有一个补充、恢复的过程。有些儿童在作了特异功能表演后，极度疲乏，甚至沉睡；有些名气功师频繁发功而早逝，都说明发功治疗与特异功能表演要消耗体内的激素和能量，意念只是起引导作用。